为什么李自成和张献忠在明朝时期那么顽强,对上满清却不堪一击呢？

题主这个问题看似宏大复杂。实则就是一个相当简单的战术问题——对待溃败之敌应该“穷寇莫追”还是“狠追猛打、斩草除根” 。
李自成和张献忠率饥民起兵。先后转战大江南北10多个省份。各自麾下兵力鼎盛时期分别达到100万和40余万之众。但是他们建立起稳固大后方根据地了吗？基本上没有。而这既是他们的战术优势。也是其最大的战略弱点。

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无论李自成还是张献忠。起兵10多年间。都失败过无数次——李自成战败了上百次。其中被打得近乎全军覆没的惨败就至少有3次。特别是崇祯十一年（1638年）孙传庭和洪承畴潼关设伏。李自成仅剩18骑逃入商洛山。但明廷却以为大功告成。没有派兵继续搜剿农民军残部。导致1年多后李自成就重整旗鼓再次出山。
张献忠比李自成狡诈得多。他在遭到明军左良玉部重创后马上接受明廷招安。却保留兵权、画地为牢。暗中休整部队、壮大军力。如果明廷及时采取强有力措施将张献忠所部分化、瓦解。又怎么可能让其在接受招安2年后就重新起兵。以至于短时间内席卷湖南、湖北、江西、四川等大片区域呢？
可见。明廷“剿匪”最大的问题就在于不够坚决、彻底。总是给自己留后患。但是等到清军入关后。前者对于农民军可就没那么客气了。而是将“兵贵神速、除敌务尽”作为最高作战原则。

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以清军追歼李自成大顺军为例。作战时间表都是以天来计算的。根本不给对手任何喘息之机。
1644年4月23日。清军在一片石击溃李自成所部。4月30日。李自成率部放弃京师西撤。2天后清军就占领北京。并安排顺治帝迁都北京。同时安抚明朝军民以笼络人心。紧接着。清军就以吴三桂所部为先锋。阿济格、多铎等亲王率主力督后。开始穷追大顺军。从5月2至3日。李自成部队连续被追兵击败。退入山西。其原本夺取的山东、河北、晋北、豫东等地区不出1个月就丢了个干干净净。
同年7月。稍微缓过一口气的李自成开始局部反攻。却在这个节骨眼上高层爆发内讧。杰出将领李岩兄弟遭诬陷被杀。农民军内部更加矛盾重重。结果。到1644年10月大顺军反攻失败。山西全境落入清军手中。山西一丢。李自成老家陕西门户洞开。2个月后（1644年底）清军发起西征。从边外绕道绥德一路攻克延安等重镇。于1645年元月攻至西安城下。因为无法坚守立足。李自成只好继续率兵撤退。出武关南下至襄阳、武昌、九江。

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由于清军追击太紧。农民军根本得不到丝毫喘息。结果连战连败。士气越来越低落。终于在1645年5月上旬李自成进入九宫山后遭地方武装袭击身亡。大顺军余部也溃散四方。可见。要想真正打败擅长流动作战的明末农民军。说到底要诀就一条——死缠烂打。
其他观点：
（一）
一支没有政治的军队。如同没有灵魂的躯壳。终究成不了大事。更谈不上有多大的战斗力。
李自成攻陷北京后。眼里只有银子而没有天下。为了区区七千万两银子将京师变成了人间地狱。却完全无视普天之下狼烟遍地和强敌环伺的现实。骨子里就是一个打家劫舍的流寇。指望一支用银子武装起来的乌合之众去抵抗职业军队。基本上就是做梦了。
张献忠在清军入关后烽烟四起的战火中。忙活的却是划地称帝。眼睛里也只有到手的一亩三分地。战争失利后的逃亡路上也不忘带上沉甸甸的银子。为银子而战自然就没其它的什么事了。
所谓的顽强只是为了生存。不堪一击是因为银子。如此而已。
（二）
李自成和张献忠在与明军作战中。屡屡起死回生。仍能顽强抵抗。并非其战斗力有多强。大体上是亡命状态下的拼死挣扎。再加上朝廷军队为其创造的机会。
但这种机会是大明朝廷给的。明朝军队没有核心的指挥体系。基本上是各自为战。即便是兵部尚书杨嗣昌出任统帅期间。尽管制定了统一的作战方案。形成了“十面合围”之势。但统兵将领大都离心离德。始终不能步调一致。关键时刻总是功亏一篑。让命悬一线的李自成和张献忠活了下来。
这不是李自成和张献忠运气好。而是朝廷的统兵将领们有各自的账本。统兵将领们之所以各算各账。也是为了生存。在国家政治一片漆黑之下。如果使出全力剿灭了李自成和张献忠。那么自己的末日也就到了。因此。让李自成和张献忠活下来。自己才有生的希望。